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Einführung in die Systembiologie

Informationen

Inhalt

Die Vorlesung gibt einen Überblick über ausgewählte Methoden der Systembiologie und deren Anwendung auf konkrete biologische Fragestellungen.
  • Geschichte der Systembiologie
  • Dynamische Systeme
  • Chemische Reaktionsnetzwerke
  • Nichtlineare dynamische Systeme (Stabilität, Bifurkation)
  • Kontrolltheorie
  • Metabolische Netzwerke
  • Maschinelles Lernen (Supervised, Un-supervised Learning)
In den begleitenden Übungen werden konkrete Beispiele behandelt. Dabei geht es um analytische Methoden, aber insbesondere um die numerische Behandlung mittels der Python. Es werden keine Vorkenntnisse in Programmierung vorausgesetzt.
 
Ilias Passwort wird in der ersten Übung am 29.04.2022 bekanntgegeben.

Skript

 

Übungen

Software

Um Software zu installieren, bitte die beschriebenen Schritt der jeweiligen Websites befolgen. Wenn eine Linux Distribution verwendet wird, bitte den beinhalteten Paketmanager (zB. apt, pacman, dnf ...) verwenden.

Das Rechenzentrum der Universität Freiburg bietet gut ausgestattete PCs mit denen die Übungen absolviert werden können, sollte die eigenen Hardware nicht ausreichen.

Literatur

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